Музей был создан на базе местных краеведческих инициатив и школьных коллекций. Первые экспонаты собирали жители станицы: предметы быта, фотографии, документы, связанные с историей Брюховецкого куреня, основанного в 1794 году. Со временем коллекция расширялась за счёт даров, находок и материалов, переданных организациями района.
Учреждение оформилось как муниципальный музей в конце XX века, став центром сохранения локальной истории и культурной памяти.
Сегодня Брюховецкий историко‑краеведческий музей — это действующая культурно‑просветительская площадка. Здесь работают постоянные экспозиции, посвящённые истории станицы, казачьему быту, военным событиям и развитию сельского хозяйства.
Музей активно взаимодействует со школами, проводит тематические занятия, экскурсии, встречи с краеведами и мероприятия, приуроченные к памятным датам. Экспозиции регулярно обновляются благодаря новым поступлениям от жителей и исследователей.
Экспозиции регулярно пополняются благодаря местным краеведам.
