По данным Ростовской-на-Дону епархии, приход в честь Живоначальной Троицы был образован в начале 2000‑х годов, когда в Батайске началось активное строительство новых жилых кварталов и возникла необходимость в новом храме.
Строительство каменного храма велось в 2000‑е годы и завершилось поэтапно: сначала была возведена основная часть здания, затем — купола, колокольня и внутреннее убранство.
Храм строился на пожертвования прихожан и благотворителей, что характерно для большинства новых приходов Ростовской области. После завершения основных работ храм был освящён и начал регулярную богослужебную жизнь.
Сегодня Храм Троицы Живоначальной — действующий приход Русской Православной Церкви, активно участвующий в духовной и социальной жизни Батайска. На территории расположены:
Внутри — светлый иконостас, современные росписи, просторный притвор. Приход проводит богослужения, занятия для детей, встречи с молодёжью, благотворительные акции.